重庆医药高等专科学校始创于1948年的中国人民解放军华东野战军第一后方医院卫生学校。2006年经教育部批准，由重庆市药剂学校、重庆市卫生学校、重庆市第二卫生学校3校合并升格组建成立，目前有大学城、沙坪坝和九龙坡3个校区。2021年铜梁新校区建设项目签约落地，新校区占地1300亩，总投资25个亿。

学校办学历史悠久、文化底蕴深厚、质量效益显著，74年来培养了15余万名优秀医药卫生人才，为重庆及西部地区培养了一大批医院护士长、医院检验科主任、医院药剂科主任、乡镇卫生院院长为代表的技术业务骨干、区县卫生行政管理部门负责人、医药企业中高层管理者等，办学实力和人才培养质量得到社会广泛认可。学校占地面积568亩，总建筑面积40万余平方米，固定资产10亿元，现有教学仪器设备值2亿元。成功承办首届全国卫生健康行业青年志愿服务项目大赛全国总决赛、第二届全国食品药品类专业云课堂教学比赛、连续2年承办全国职业院校技能大赛（高职组）护理大赛；教师、学生参加全国大赛获奖数量在全国1400余所高职高专院校中名列前茅，在2020年中国高职高专学校排行榜中排名全国150多所高等专科学校第5。在2021中国高等职业院校改革活力指数排行榜中位居医药类高职院校第1。2015年以来，时任中共中央政治局常委、全国人大常委会委员长张德江，时任国务院副总理刘延东等党和国家领导人先后视察学校，充分肯定了学校的办学水平。

学校有教职工950人，专任教师中高级职称占比超过30%，其中博士占比达15%。拥有全国名老中医学术传承工作室专家、国家卫生职业教育教学指导委员会校院合作专委会主任委员、国家卫生职业教育教学指导委员会委员、全国食品药品教学指导委员会药物制剂专业委员会主任委员、第二届全国名中医、国家“万人计划”教学名师、全国优秀教师、全国青少年培养导师、全国黄炎培职业教育杰出奖获得者、重庆市名师、重庆市中青年医药高端人才、重庆市名中医指导教师、重庆市学术技术带头人、重庆市“十佳教师”、重庆市教书育人楷模、重庆中医药学会会长、重庆市全科医学会会长等为代表的一批优秀教师，208人次担任国家、省级一级行业协会、全国行业或教学指导委员会成员。学校教师近3年担任全国教材主编70人次，省部级以上课题立项数、获奖数、三大检索论文数，均居全市高职高职前列。R＆D投入与支出位居重庆市高职院校第4，授权专利数562项位居全市高职院校前5名，成果转让合同金额位居重庆市高职院校第2名，2020年发明专利授权列全国高职院校25名，重庆第4。获国家教学成果奖1项，全国卫生行指委教学成果一等奖1项，重庆市教学成果奖5项，重庆市人民政府科技进步奖2项，重庆市人民政府社会科学成果奖2项。在全国高职院校改革活力排行榜列81位，是前100名内唯一的医药类学校；在科技创新活力分榜前50强中列29，排全国医药类院校第1。

在十四五期间，学校将坚持新发展理念、构建新发展格局，加速推进“双高”建设，立足重庆、服务全国、面向世界，精准对接健康服务、智慧医疗和药学服务等大健康产业发展需要，培养具有良好医药职业素养的复合型技术技能人才，开展技术技能创新，服务、引领产业发展。以药学专业群、护理专业群为龙头，推进医养、医技、医工、医管等专业群协调发展，努力把学校打造成主干专业优势突出、行业办学特色鲜明、国内领先、国际可交流的医药职业教育院校。

学校面向在职人员开设了药学、临床医学、中医学、医学检验技术、护理、针灸推拿、眼视光技术等专业的成人专科学历教育，为医药卫生行业从业人员提供继续深造、提高业务水平的学习平台。