黑龙江中医药大学兴建于1954年，经六十余年的基本建设与发展趋势，院校已变成具备较高课堂教学、科学研究、医疗水平，在世界各国有一定危害的高中医药学学校。
黑龙江中医药大学内设11个学校、13个附院（4个直属机关）、一个中医药学研究所、一个中医药学高等职业教育研究所、二十六个教学医院和70个见习产业基地。
黑龙江中医药大学设立25个大学专业，包含医、理、文、工、管、法等6个学科类别。有博士研究生授予权一级学科4个、二级学科31个；有研究生学位授予权一级学科五个、二级学科37个；有博士研究生专业学位授权点一个，研究生专业学位授权点4个。目前全日制教育在校学生16417人，在其中博士生402人、研究生2348人、本科毕业12639人、大专生726人、留学人员236人、预科生66人。
黑龙江中医药大学设立中医药学、中医药学、中西医、药理学4个博士研究生科学研究流动站，是國家第一类重点学科（中医药学、药物制剂专业和针灸推拿学）和第一批第二类重点学科（中医药学）基本建设点。
中药材类人才的培养方式自主创新试验区为国家教育部第一批人才的培养方式自主创新试验区，中医临床人才的培养方式自主创新试验区为黑龙江人才的培养方式自主创新试验区。
今年，黑龙江中医药大学中医药学、中医药学、康复治疗学三个技术专业获评國家一流本科技术专业，中医药学、中医药学、康复治疗学、针灸推拿学、中西医结合临床医学专业、药理学和医学研究技术性七个技术专业获评省部级一流本科专业建设点。在全国性第四轮学科评定中，中医药学学科排名并列第一、中医药学学科排名并排第四，变成全国性评为“A+”课程的三所中医药学学校之一。
黑龙江中医药大学有國家重点发展学科4个、国家中医药管理局重点发展学科21个、省部级重点发展学科11个、省拔尖人才队伍18个；有国家级别课堂教学精英团队三个、省部级课堂教学精英团队五个；有國家开放课程8门、國家精典共享资源课程内容8门、省开放课程22门、省线上开放课程1门。
黑龙江中医药大学2次获全国性出色高等职业教育科学研究组织头衔，曾依次获國家教学成果一等奖2项、二等奖7项、省部级教学成果奖57项。实验教学管理中心为全国性中医药学学校第一批明确的“国家级别教学实验示范性管理中心”；中医药学历史博物馆被明确为黑龙江省中医药学历史博物馆；中医药学文献资料管理中心被明确为国家中医药文献资料管理中心黑龙江省中心，为国家中医药管理局第一批科研项目查新指定企业。
黑龙江中医药大学目前国家教育部工程项目研究所一个、重点实验室一个，国家中医药管理局研究所一个、重中之重调研室三个、三级实验室10个；黑龙江工程项目管理中心一个、重点实验室八个，省一般高等院校重点实验室五个，省校企合作办学工程设计管理中心两个；有国家科技部中医药学国际性高新科技协作产业基地一个，国家中医药管理局中医药学国际性高新科技协作产业基地一个，黑龙江中医药学国际性高新科技协作产业基地一个，黑龙江自主创新服务平台一个。
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